More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1944 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.73 
 
 		 695 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  51.98 
 
 		 694 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.96 
 
 		 682 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.15 
 
 		 689 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  62.96 
 
 		 672 aa  792    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.81 
 
 		 733 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.61 
 
 		 689 aa  653    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  62.07 
 
 		 672 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.66 
 
 		 682 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  59.79 
 
 		 674 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.17 
 
 		 687 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2973  peptidyl-dipeptidase  62.65 
 
 		 673 aa  754    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.9 
 
 		 695 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  60.41 
 
 		 671 aa  811    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  63.11 
 
 		 672 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 678 aa  1368    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  52.08 
 
 		 685 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.22 
 
 		 689 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.66 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.44 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.33 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.23 
 
 		 683 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.19 
 
 		 681 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.93 
 
 		 694 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0332  M3 family peptidase  47.84 
 
 		 674 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.26 
 
 		 696 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.49 
 
 		 696 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  47.95 
 
 		 693 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.95 
 
 		 696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.76 
 
 		 696 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  49.19 
 
 		 692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.57 
 
 		 716 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.14 
 
 		 717 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.76 
 
 		 717 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.06 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  42.42 
 
 		 780 aa  518  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.06 
 
 		 726 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1608  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.12 
 
 		 687 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000301747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 		 687 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.35 
 
 		 729 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.77 
 
 		 734 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.18 
 
 		 725 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.91 
 
 		 734 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.77 
 
 		 734 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.62 
 
 		 726 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.77 
 
 		 734 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0143  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.52 
 
 		 734 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.62915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.04 
 
 		 729 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.47 
 
 		 742 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.11 
 
 		 714 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.33 
 
 		 742 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.33 
 
 		 742 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4267  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.71 
 
 		 746 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.72 
 
 		 726 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.95 
 
 		 848 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.06 
 
 		 728 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.92 
 
 		 716 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.87 
 
 		 716 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  37.3 
 
 		 709 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.12 
 
 		 718 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.98 
 
 		 712 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.57 
 
 		 716 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  40.12 
 
 		 722 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.87 
 
 		 716 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.36 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.01 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  38 
 
 		 716 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.01 
 
 		 722 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.45 
 
 		 736 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.7 
 
 		 716 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38 
 
 		 716 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.13 
 
 		 712 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.7 
 
 		 716 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.93 
 
 		 720 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.46 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.66 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.19 
 
 		 683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.35 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.37 
 
 		 723 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.32 
 
 		 714 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.32 
 
 		 714 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.36 
 
 		 714 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.17 
 
 		 733 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.72 
 
 		 718 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.32 
 
 		 714 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.87 
 
 		 714 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.02 
 
 		 714 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.57 
 
 		 711 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.32 
 
 		 716 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.22 
 
 		 715 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.96 
 
 		 715 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.96 
 
 		 715 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.16 
 
 		 716 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.61 
 
 		 718 aa  422  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  36.69 
 
 		 675 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.46 
 
 		 726 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.73 
 
 		 677 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.91 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  35.3 
 
 		 671 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  35.18 
 
 		 681 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>