More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2373 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  100 
 
 		 407 aa  808    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 830 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  30.55 
 
 		 415 aa  179  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  33.74 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  32 
 
 		 431 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  30.71 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.24 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  28.92 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  30.05 
 
 		 425 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  33 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  30.68 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  27.58 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  29.48 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  29.18 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  30.03 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  26.27 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.76 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  30.75 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.9 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.26 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  28.32 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  26.78 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.89 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  29.19 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.55 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.65 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  26.03 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.4 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  24.88 
 
 		 429 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  27.43 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  26.54 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.06 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  27.27 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.75 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.73 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.93 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.28 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  27.14 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.32 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.32 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.41 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.82 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.7 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.23 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.53 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.96 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.96 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.05 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.08 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.09 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  27.38 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  26.24 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.59 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.98 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  26.81 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.64 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  25.42 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.84 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.54 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.15 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  24.69 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  25.36 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.48 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.69 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.34 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.72 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  22.63 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1033  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.32 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.1 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.67 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  26.07 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.61 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.99 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.99 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.5 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.38 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  25.61 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  25.06 
 
 		 643 aa  89.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.11 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>