More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1119 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  100 
 
 		 411 aa  823    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  43.98 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  43.81 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  40.67 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  40.1 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  40.39 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  36 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  35.38 
 
 		 723 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  31.3 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.8 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  30.5 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.93 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  29.65 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  30.65 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.61 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.08 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.41 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  26.28 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.3 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.68 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.31 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  29.34 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  29.34 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.07 
 
 		 756 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.07 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.17 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.4 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.99 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.39 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 		 914 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  26.57 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 		 900 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.17 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.56 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.8 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.9 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.36 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.33 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.33 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1518  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.92 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0122051  normal  0.737322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  25.48 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.39 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.67 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.14 
 
 		 894 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.48 
 
 		 924 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.65 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 896 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.34 
 
 		 926 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  26.89 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.07 
 
 		 904 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.61 
 
 		 891 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.3 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.3 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  29.27 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.56 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  24.8 
 
 		 904 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  24.84 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  24.39 
 
 		 912 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1011  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  23.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  27.4 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2715  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.37 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.38 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.54 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.42 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.43 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.9 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  28.64 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.01 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.33 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.36 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.99 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.43 
 
 		 1065 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.37 
 
 		 1079 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0906  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.22 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0902  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.22 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004478  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.26 
 
 		 1077 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.72 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.5 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.17 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4090  acetyl CoA carboxylase, biotin carboxylase subunit  22.41 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1271  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.18 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5425  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1030  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.44 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1265  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.47 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0289407  hitchhiker  0.00381456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.4 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  26.87 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  28.16 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1142  biotin carboxylase  24.04 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.33 
 
 		 1076 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.07 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06950  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.68 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.414561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33770  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  26.79 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.23 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.32 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0073  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.26 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  26.47 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  26.92 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1065  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.78 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000015139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>