106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0882 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  324  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  76.35 
 
 		 327 aa  238  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  76.03 
 
 		 147 aa  237  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  73.65 
 
 		 327 aa  235  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  72.97 
 
 		 327 aa  235  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  73.65 
 
 		 327 aa  234  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  74.32 
 
 		 327 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  74.48 
 
 		 327 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  71.92 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  60.14 
 
 		 327 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  47.59 
 
 		 325 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  47.59 
 
 		 325 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  46.21 
 
 		 325 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  48.28 
 
 		 271 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  44.83 
 
 		 325 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.83 
 
 		 325 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  44.83 
 
 		 325 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  44.14 
 
 		 325 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  46.62 
 
 		 326 aa  133  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  45.27 
 
 		 326 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  44.14 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  44.14 
 
 		 325 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  42.57 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  47.01 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  47.01 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  47.01 
 
 		 293 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  47.01 
 
 		 325 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  47.01 
 
 		 238 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  46.27 
 
 		 325 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  46.27 
 
 		 325 aa  123  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  45.52 
 
 		 325 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  42.07 
 
 		 325 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  44.03 
 
 		 323 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  45.52 
 
 		 325 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  43.15 
 
 		 326 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  44.03 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  42.07 
 
 		 326 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  45.52 
 
 		 325 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  44.96 
 
 		 316 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  41.79 
 
 		 325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  44.03 
 
 		 329 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  41.38 
 
 		 326 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  41.79 
 
 		 325 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  42.22 
 
 		 325 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  40.69 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  42.54 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  41.79 
 
 		 326 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  42.54 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  43.28 
 
 		 325 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  41.79 
 
 		 325 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  41.04 
 
 		 186 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  41.79 
 
 		 325 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  41.04 
 
 		 325 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  41.04 
 
 		 323 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  40.69 
 
 		 326 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  41.79 
 
 		 326 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  42.64 
 
 		 336 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  34.97 
 
 		 344 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  34.97 
 
 		 344 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  33.12 
 
 		 341 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  33.12 
 
 		 341 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  33.74 
 
 		 344 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  32.08 
 
 		 345 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  35 
 
 		 329 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  32.1 
 
 		 209 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  34.84 
 
 		 345 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  34.38 
 
 		 341 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  30.82 
 
 		 349 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  29.71 
 
 		 370 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  31.87 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  32.52 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  31.71 
 
 		 347 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  31.58 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2325  molybdopterin binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  31.61 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  27.12 
 
 		 377 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>