More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1061 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  84.47 
 
 
223 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1866  ABC transporter related  86.7 
 
 
226 aa  374  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.937641  normal  0.767645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1399  ABC transporter related  85.58 
 
 
223 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  61.36 
 
 
243 aa  276  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  61.4 
 
 
238 aa  268  5e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  53.18 
 
 
235 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  51.12 
 
 
225 aa  230  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 
236 aa  218  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.98 
 
 
224 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.69 
 
 
231 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  53.47 
 
 
223 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  52.15 
 
 
264 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  53.92 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  52.45 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.22 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  52.27 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  53.92 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.12 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.63 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.63 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.22 
 
 
225 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 
253 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  47.01 
 
 
250 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
246 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
222 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.54 
 
 
236 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.96 
 
 
233 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 
232 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50.68 
 
 
224 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.2 
 
 
236 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.35 
 
 
253 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.89 
 
 
230 aa  207  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  54.23 
 
 
276 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
224 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.18 
 
 
239 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
248 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  52.94 
 
 
227 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  52.02 
 
 
234 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  50.45 
 
 
228 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.34 
 
 
253 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.86 
 
 
236 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  48.7 
 
 
287 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  49.78 
 
 
225 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.53 
 
 
230 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48 
 
 
241 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  44.89 
 
 
226 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  47.75 
 
 
225 aa  204  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  46.67 
 
 
247 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.32 
 
 
252 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.17 
 
 
225 aa  204  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  204  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.17 
 
 
225 aa  204  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  52.68 
 
 
236 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.56 
 
 
238 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.75 
 
 
237 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  49.02 
 
 
231 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.56 
 
 
229 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  49.27 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  46.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  47.57 
 
 
231 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
225 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  47.87 
 
 
217 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  50.5 
 
 
228 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  50.73 
 
 
217 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  52.71 
 
 
221 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  48.86 
 
 
229 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  50 
 
 
241 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.58 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.01 
 
 
226 aa  202  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.58 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.93 
 
 
242 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
224 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
252 aa  201  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  48.93 
 
 
276 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  49.55 
 
 
241 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 
241 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.19 
 
 
226 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 
222 aa  201  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  51.96 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  52.71 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.11 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.54 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>