More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0928 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 387 aa  763    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  64.04 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1917  glutamyl-tRNA reductase  56.23 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.406636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0096  glutamyl-tRNA reductase  54.34 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2261  glutamyl-tRNA reductase  54.45 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.200572  normal  0.0151163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2034  glutamyl-tRNA reductase  53.63 
 
 		 391 aa  345  7e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000938392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1730  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0393271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0214  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000943569  normal  0.0144632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  29.03 
 
 		 449 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3451  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.341697  normal  0.0956626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  29.47 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.17 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  29.39 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  28.2 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  28.02 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  28.79 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.72 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.72 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  29.4 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  26.49 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  31.53 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  31.18 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  28.16 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  27.62 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  26.63 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  28.62 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.32 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  29.86 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  30.35 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  28.67 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  27.4 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  27.24 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  29.32 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.23 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  29.78 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  28.79 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  28.01 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  27.81 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.24 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  30.43 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  30.23 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  29.86 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  30.04 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  29.04 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  27.19 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  33.46 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  32.96 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  32.96 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 436 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  32.96 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  26 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  28.08 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.97 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  28.11 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  26.82 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  28.04 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>