More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1730 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1730  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 406 aa  804    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0393271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  35.79 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1917  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 393 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.406636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0096  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2034  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000938392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2261  glutamyl-tRNA reductase  33.52 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.200572  normal  0.0151163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  28.76 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  27.97 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0214  glutamyl-tRNA reductase  28.72 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000943569  normal  0.0144632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  28.49 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  28.65 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  29.04 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  27.89 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.65 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  30.45 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  26.23 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  28.3 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.11 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  27.22 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  27.78 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.2 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  28.17 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.63 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.65 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  31.29 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  28.48 
 
 		 432 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 422 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  29.3 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  27.81 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.72 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  26.7 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 428 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  27.39 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.66 
 
 		 426 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  27.89 
 
 		 443 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  32.12 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  25.31 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  30.66 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  29.28 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  26.73 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  26.93 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  24.63 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0249  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  27.67 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  25.79 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  25.79 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  25.79 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  25.79 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.26 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>