More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1160 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 426 aa  855    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0214  glutamyl-tRNA reductase  42.96 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000943569  normal  0.0144632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  25.81 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  26.92 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1730  glutamyl-tRNA reductase  29.04 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0393271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.4 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1917  glutamyl-tRNA reductase  26.7 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.406636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 432 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0096  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  25.64 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0524  glutamyl-tRNA reductase  25.96 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.534347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  27.36 
 
 		 443 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2261  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.200572  normal  0.0151163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  26.44 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  24.29 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  27.2 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  25.36 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  26.17 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.71 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  25.48 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  29.13 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  25.24 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  24.58 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  26.61 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  27.62 
 
 		 411 aa  126  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  25.88 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  28.21 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  25.86 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  26.63 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  25.37 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  24.46 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  26.61 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  24.56 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  25.39 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  26.74 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  26.33 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  25.06 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.95 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  25.26 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  26.23 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  26.49 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  25.68 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  32.97 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  25.62 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  25.32 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  23.66 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  29.92 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  27.15 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  23.39 
 
 		 443 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  24.7 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  23.96 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.48 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  27.85 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  24.22 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  27.21 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  25.14 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  26.5 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  25.47 
 
 		 441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  28.7 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  24.81 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  24.22 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  29.47 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2034  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000938392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  26.49 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  25.58 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>