More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0859 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 432 aa  892    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1326  glutamyl-tRNA reductase  48.38 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  45.45 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  43.87 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 422 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  42.33 
 
 		 435 aa  359  4e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  44.1 
 
 		 432 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  43.87 
 
 		 432 aa  353  5e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  43.63 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  41.59 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.67 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  31.78 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  30.63 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.91 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  31.04 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  29.48 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  30.32 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.71 
 
 		 465 aa  199  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  30.64 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  29.58 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  29.78 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  29.09 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.98 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  29.63 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 464 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 425 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  31.23 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.57 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  30.64 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  29.66 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  31.57 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  28.97 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.62 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  28.89 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  27.95 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  27.82 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1281  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  33.62 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>