More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0688 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
422 aa  860    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  59.81 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  58.39 
 
 
435 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  58.59 
 
 
428 aa  487  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  57.78 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  56.77 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1326  glutamyl-tRNA reductase  57.63 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  56.77 
 
 
432 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  56.53 
 
 
432 aa  458  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 
432 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 
436 aa  242  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 
434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 
434 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 
434 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.98 
 
 
434 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  34.75 
 
 
443 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 
458 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.71 
 
 
440 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.57 
 
 
443 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.83 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
430 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
450 aa  196  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 
438 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 
442 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 
424 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 
425 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.5 
 
 
464 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 
432 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 
425 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 
441 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 
436 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 
439 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 
420 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 
436 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 
464 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 
428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.43 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  31.2 
 
 
422 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.4 
 
 
428 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 
434 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 
422 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 
425 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.31 
 
 
426 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  29.45 
 
 
440 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.43 
 
 
436 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 
422 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.5 
 
 
422 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 
418 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 
425 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 
425 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 
432 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 
438 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 
419 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 
425 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 
425 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 
446 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 
446 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 
418 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  30.63 
 
 
416 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  29.86 
 
 
425 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 
446 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 
428 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 
432 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 
428 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 
446 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 
435 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 
418 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  29.93 
 
 
432 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 
418 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 
459 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  28.95 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 
444 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.19 
 
 
429 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  30.57 
 
 
420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.4 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  28.9 
 
 
435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 
455 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 
441 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  30.16 
 
 
425 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>