More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1388 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  97.69 
 
 
432 aa  857    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
432 aa  879    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  97.69 
 
 
432 aa  858    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  68.13 
 
 
435 aa  590  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  57.48 
 
 
428 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  56.42 
 
 
427 aa  462  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  56.53 
 
 
422 aa  458  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  54.73 
 
 
429 aa  449  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1326  glutamyl-tRNA reductase  49.3 
 
 
433 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  44.1 
 
 
432 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 
434 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 
434 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 
434 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 
436 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 
434 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.52 
 
 
434 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.55 
 
 
434 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 
443 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.52 
 
 
443 aa  216  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 
430 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 
442 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 
458 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
421 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.02 
 
 
443 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
440 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
450 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.47 
 
 
458 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.14 
 
 
429 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  32.06 
 
 
425 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 
422 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.71 
 
 
461 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 
422 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 
465 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 
426 aa  192  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 
420 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 
441 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 
428 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 
438 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 
421 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 
446 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 
398 aa  186  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 
464 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 
426 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 
432 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 
425 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 
444 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 
420 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 
418 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 
416 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 
436 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 
418 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 
422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 
423 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
444 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
444 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
444 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
444 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  31.47 
 
 
408 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 
444 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 
444 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 
446 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  31.14 
 
 
425 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.62 
 
 
454 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 
444 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 
444 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 
443 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 
419 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 
425 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 
459 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 
425 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 
425 aa  176  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 
446 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.87 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  30.63 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 
424 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  29.46 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  30.98 
 
 
432 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 
440 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
431 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 
426 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
434 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 
448 aa  170  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.45 
 
 
432 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 
416 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 
436 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  29.22 
 
 
434 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 
416 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>