99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0305 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
353 aa  700    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  75.3 
 
 
355 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  75.14 
 
 
349 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  74.34 
 
 
356 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  24.36 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  24.36 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  24.73 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.18 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.51 
 
 
611 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  33.53 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  33.53 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  32.91 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  29.77 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.6 
 
 
213 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  29.95 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.6 
 
 
213 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  25.27 
 
 
559 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  31.82 
 
 
175 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  32.76 
 
 
184 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  28.57 
 
 
176 aa  56.6  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  29.17 
 
 
162 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  28.15 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.75 
 
 
622 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  31.91 
 
 
190 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.93 
 
 
176 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  30.17 
 
 
197 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  31.3 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 
234 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  31.78 
 
 
620 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.09 
 
 
188 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.43 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.18 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.89 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.89 
 
 
242 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.89 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  32.67 
 
 
203 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.89 
 
 
207 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.83 
 
 
242 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.89 
 
 
207 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  30 
 
 
193 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  24.01 
 
 
550 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  27.48 
 
 
758 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.09 
 
 
207 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 
184 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
556 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.76 
 
 
252 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  28.7 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.1 
 
 
536 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  26.09 
 
 
448 aa  48.9  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  29.19 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 
191 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  31.86 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  23.29 
 
 
558 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.13 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  27.05 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.47 
 
 
481 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  26.32 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 
487 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.95 
 
 
219 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  26.72 
 
 
180 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.19 
 
 
586 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.84 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  26.52 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.75 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  35.19 
 
 
478 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  28.36 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.67 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  25.86 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  27.64 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.38 
 
 
551 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  28.8 
 
 
439 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 
560 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  29.66 
 
 
532 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.48 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  25.79 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  27.59 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.4 
 
 
494 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25.79 
 
 
286 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  27.59 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.4 
 
 
494 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 
489 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  23.97 
 
 
183 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  36.71 
 
 
541 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  24.65 
 
 
169 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  30 
 
 
486 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  30 
 
 
486 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  26.56 
 
 
151 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1918  cardiolipin synthetase domain protein  28.45 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.71 
 
 
193 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 
505 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  26.72 
 
 
483 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 
505 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.29 
 
 
260 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>