More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2203 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 441 aa  882    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  47.97 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  47.02 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  43.88 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  46.27 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.33 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  32.5 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  31.32 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.42 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.94 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.49 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.26 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.32 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.03 
 
 		 455 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.81 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.58 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  32.13 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.98 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.01 
 
 		 437 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.75 
 
 		 468 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.87 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.54 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  30.82 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.99 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.47 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.83 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  31.11 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.71 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.47 
 
 		 446 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  28.05 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  30.09 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.86 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.66 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.77 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  30.57 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.25 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.6 
 
 		 453 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  29.86 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  29.82 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.05 
 
 		 453 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  30.44 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.38 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.29 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.86 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  29.74 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  29.29 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  29.74 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  29.74 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.85 
 
 		 616 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  29.74 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  28.8 
 
 		 493 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  28.6 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  28.85 
 
 		 616 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  28.8 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.8 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  28.8 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  28.8 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  28.8 
 
 		 493 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  28.8 
 
 		 495 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  28.8 
 
 		 495 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  28.67 
 
 		 435 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.45 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.79 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.45 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.57 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  29.35 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  29.68 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  29.22 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  28.67 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  31.68 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  28.7 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  28.95 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  28.44 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  29.13 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  29.27 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  28.92 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  28.92 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  28.92 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  28.92 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  28.92 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.38 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.24 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.02 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  31.49 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.91 
 
 		 477 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.9 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.76 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.67 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.37 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.31 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.67 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  29.32 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  29.28 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>