75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1921 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  48.2 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  42.6 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  42.03 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  39.71 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  30.5 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  29.82 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.3 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  33.96 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.33 
 
 		 142 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  28.93 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0260  hypothetical protein  39.51 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  28.75 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.94 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.14 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.39 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  25.63 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  26.13 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  26.06 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  27.5 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.62 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  24.03 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.91 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  25.15 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  25.15 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  26.34 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  25.53 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.42 
 
 		 148 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.29 
 
 		 153 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.48 
 
 		 169 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.14 
 
 		 147 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  23.93 
 
 		 151 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  26.85 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.3 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.5 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.3 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  23.42 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.82 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  30.77 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  22 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  29.38 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.16 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  27.62 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.58 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  25.15 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1206  hypothetical protein  30.97 
 
 		 163 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 147 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.49 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.57 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.49 
 
 		 158 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  26.11 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  28.39 
 
 		 149 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  25.62 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  23.53 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 151 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.06 
 
 		 139 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>