52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03254 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  100 
 
 		 346 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  53.87 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  40.11 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  36.6 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  36.52 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  37.93 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  38.11 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  38.29 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  36.71 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  37.5 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  37.64 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  37.22 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  37.22 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  37.22 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  36.02 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  36.39 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  35.84 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  35.33 
 
 		 386 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  33.71 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  35.28 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  34.02 
 
 		 390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  37.98 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  39.14 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  38.49 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  33.65 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  33.11 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  34.3 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 418 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  32.17 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  31.95 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  32 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  30.32 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  29.41 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  30.09 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  31.73 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.02 
 
 		 477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  30.25 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  29.28 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  30.06 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.45 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  30.64 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  28.34 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  26.5 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  27.71 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  26.52 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.64 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  27.63 
 
 		 593 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  22.38 
 
 		 569 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  23.95 
 
 		 635 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  24.15 
 
 		 491 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>