66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02953 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  100 
 
 		 296 aa  567  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  65.47 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  65.47 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  64.19 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  33.01 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  30.74 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  30.06 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  28.88 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.38 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.28 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  29.37 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.21 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.86 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.06 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  29.68 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  25.63 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  31.08 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.69 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  31.29 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  28.8 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  22.73 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  22.73 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  28.8 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.86 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  28.11 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.02 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  28.25 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  27.14 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  30.93 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  25.63 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  29.17 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  29.17 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.11 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  27.04 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  29.17 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  28.82 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  31.13 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.3 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  28.47 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.95 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  27.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  27.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  38.46 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  30.14 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  30 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  29.13 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  27.12 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  27.75 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  27.72 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  32.08 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.16 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  26.1 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  33.15 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  24.76 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  26.04 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  31.53 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  30.65 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  24.76 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>