More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4877 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  100 
 
 		 476 aa  946    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  85.17 
 
 		 447 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  61.38 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  56.63 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  56.85 
 
 		 443 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  56.28 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  57.01 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  55.56 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  55.38 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  54.78 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  49.04 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  47.76 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  45.88 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  48.39 
 
 		 478 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  48.95 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  48.95 
 
 		 482 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  49.16 
 
 		 482 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  46.98 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.76 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  47.57 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  47.18 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  48.15 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  47.93 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  41.93 
 
 		 439 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  42.83 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  42.19 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  34.09 
 
 		 494 aa  233  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  33.73 
 
 		 732 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  32.59 
 
 		 590 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  32.76 
 
 		 595 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  33.17 
 
 		 586 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  32.01 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  31.86 
 
 		 595 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.17 
 
 		 599 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  30.54 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.86 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.95 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.71 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  30.91 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.41 
 
 		 596 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.98 
 
 		 601 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.73 
 
 		 596 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.79 
 
 		 608 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  31.13 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  28.64 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.46 
 
 		 567 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  27.64 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.79 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  28.93 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  28.93 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  28.95 
 
 		 542 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  26.28 
 
 		 540 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  29.82 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  26.35 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  26.28 
 
 		 540 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  29.35 
 
 		 553 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  29.17 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  26.02 
 
 		 540 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  24.62 
 
 		 540 aa  133  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  26.21 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  30.73 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  33.85 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  34.94 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  31.34 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  26.24 
 
 		 633 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  26.82 
 
 		 648 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  27.32 
 
 		 551 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  24.89 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.91 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  24.81 
 
 		 643 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  24.87 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  27.68 
 
 		 621 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.89 
 
 		 570 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.27 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  29.72 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  32.9 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.3 
 
 		 805 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  28.05 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  27.02 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  27.55 
 
 		 569 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.38 
 
 		 793 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  27.95 
 
 		 639 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  26.9 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  31.42 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.58 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  31.28 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.82 
 
 		 590 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>