263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2470 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  100 
 
 		 363 aa  750    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  90.08 
 
 		 366 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  82.77 
 
 		 372 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  65.3 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  60.46 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  63.41 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  59.38 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  54.67 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  59.05 
 
 		 322 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.75 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  56.33 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  53.45 
 
 		 362 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  56.17 
 
 		 316 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  56.92 
 
 		 313 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  56.92 
 
 		 313 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  56.92 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  56.92 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  54.43 
 
 		 312 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  54.18 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  54.13 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  54.89 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  55.21 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  53.12 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.5 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  46.82 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  45.13 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  46.03 
 
 		 303 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  45.86 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  45.98 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  46.62 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  45.37 
 
 		 303 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  44.13 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  44.24 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  44.09 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  43.95 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.05 
 
 		 307 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.11 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  43.49 
 
 		 308 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  44.23 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  43.41 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.8 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  42.14 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  46.08 
 
 		 302 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  40.34 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  41.99 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.18 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.87 
 
 		 406 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  39.29 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  54.26 
 
 		 183 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  54.26 
 
 		 183 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  38.32 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  37.54 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  38.75 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  38.75 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  37.34 
 
 		 281 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  64.39 
 
 		 197 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  37.81 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.08 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  37.46 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  38.91 
 
 		 287 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  39.25 
 
 		 281 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  35.36 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.39 
 
 		 342 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.2 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  34.13 
 
 		 533 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  34.01 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  34.54 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  32.72 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  32.8 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  60.16 
 
 		 131 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  60.16 
 
 		 131 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  34.46 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  35.52 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  33.66 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  34.29 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.76 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  30.62 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.03 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  28.33 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  35.98 
 
 		 247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  32.62 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.39 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  25.93 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.69 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  31.64 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.37 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.18 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.06 
 
 		 305 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.98 
 
 		 303 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.44 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  24.68 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.37 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.37 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.64 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.01 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.01 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.34 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>