More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5186 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  61.84 
 
 
531 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  100 
 
 
530 aa  1066    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  61.96 
 
 
530 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  94.15 
 
 
530 aa  986    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  65.85 
 
 
530 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  60.57 
 
 
529 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
548 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  37.6 
 
 
528 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
555 aa  302  9e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  37.45 
 
 
536 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  34.85 
 
 
537 aa  293  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
531 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  36.28 
 
 
528 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  36.08 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.12 
 
 
549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
552 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
592 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  41.74 
 
 
531 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
556 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
576 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
619 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
548 aa  209  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
537 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
531 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  30.2 
 
 
694 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
566 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.7 
 
 
530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  31.7 
 
 
530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
679 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  27.9 
 
 
587 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
678 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
565 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
642 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.84 
 
 
682 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
705 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
571 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
572 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.09 
 
 
547 aa  136  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
566 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  27.54 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.68 
 
 
578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
568 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  33.18 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  27.12 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.73 
 
 
555 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
559 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.62 
 
 
491 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
364 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  32.73 
 
 
481 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.74 
 
 
752 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
582 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  26.44 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
801 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  33.62 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 
525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.57 
 
 
546 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
540 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  29.7 
 
 
611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.18 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1168 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.85 
 
 
747 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
498 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  32.74 
 
 
502 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
502 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.15 
 
 
561 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  31.65 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.17 
 
 
747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  31.67 
 
 
853 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  25.43 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  32.72 
 
 
234 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.07 
 
 
747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
680 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  31.19 
 
 
465 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
367 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
695 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  31.19 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  31.96 
 
 
367 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
874 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  31.19 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  31.19 
 
 
465 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  29.38 
 
 
801 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  36.65 
 
 
506 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
852 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.42 
 
 
517 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.51 
 
 
598 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  31.65 
 
 
458 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
689 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
655 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
492 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  30.67 
 
 
483 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>