More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4669 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  92.19 
 
 		 320 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  61.29 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  60.32 
 
 		 333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  60.58 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  59.16 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  59.68 
 
 		 333 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  60.19 
 
 		 321 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  64.21 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  59.02 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  58.92 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  58.52 
 
 		 316 aa  335  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  58.39 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  58.1 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  55.77 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  59.42 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  59.74 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  56.51 
 
 		 335 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  56.51 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 403 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.54 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.34 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  32.28 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.82 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  30.84 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  36.45 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  30.52 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  30.52 
 
 		 403 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  35.36 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  35.26 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 403 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 408 aa  145  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  30.94 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  32.91 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.41 
 
 		 507 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  35.76 
 
 		 400 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  36.46 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  35.44 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 403 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.88 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  34.49 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  32.99 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 537 aa  135  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  36.46 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  33.65 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  36.05 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  32 
 
 		 510 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  31.43 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  32.25 
 
 		 403 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.67 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.65 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  31.46 
 
 		 515 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  30.11 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  30.34 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  31.89 
 
 		 515 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 516 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  34.49 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  31.38 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  30.07 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  33.55 
 
 		 506 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  33.55 
 
 		 506 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  30.32 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  35.14 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  30.32 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  31.03 
 
 		 514 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  31.03 
 
 		 514 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  33.02 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  32.57 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  34.35 
 
 		 545 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  31.51 
 
 		 520 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  33.87 
 
 		 413 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  37.36 
 
 		 411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  30 
 
 		 515 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  34.91 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  32.27 
 
 		 516 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83915  threonine deaminase  30.65 
 
 		 539 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370739  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  31.03 
 
 		 514 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  32.37 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  32.21 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  30.98 
 
 		 514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.41 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  30.69 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>