75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4063 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47090  putative protease  95.64 
 
 		 642 aa  1244    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 644 aa  1306    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.02 
 
 		 669 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.01 
 
 		 309 aa  220  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.36 
 
 		 311 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.14 
 
 		 314 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.79 
 
 		 316 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.97 
 
 		 686 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  40.41 
 
 		 631 aa  191  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.69 
 
 		 272 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.21 
 
 		 337 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.36 
 
 		 724 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.17 
 
 		 273 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  36.73 
 
 		 741 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  39.04 
 
 		 961 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.41 
 
 		 305 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.3 
 
 		 701 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  38.89 
 
 		 314 aa  144  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.06 
 
 		 721 aa  144  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.7 
 
 		 743 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.98 
 
 		 422 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.34 
 
 		 720 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.09 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  31.58 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.15 
 
 		 301 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.15 
 
 		 301 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 		 850 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.75 
 
 		 295 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.43 
 
 		 294 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.66 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.14 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.14 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.51 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.34 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.32 
 
 		 269 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.72 
 
 		 305 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.72 
 
 		 305 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.74 
 
 		 802 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.23 
 
 		 309 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.77 
 
 		 281 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.1 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  26.75 
 
 		 952 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.75 
 
 		 298 aa  51.6  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.9 
 
 		 356 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.78 
 
 		 268 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  26.04 
 
 		 334 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.18 
 
 		 293 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.31 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.14 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.16 
 
 		 232 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.33 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.36 
 
 		 283 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.89 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  29.27 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  28.34 
 
 		 283 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.09 
 
 		 297 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  29.01 
 
 		 256 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.44 
 
 		 315 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.85 
 
 		 297 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  28.34 
 
 		 325 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  26.73 
 
 		 247 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.18 
 
 		 348 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.72 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.88 
 
 		 284 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.78 
 
 		 289 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.76 
 
 		 272 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.88 
 
 		 284 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.88 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.88 
 
 		 284 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.9 
 
 		 170 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.85 
 
 		 470 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  28.57 
 
 		 275 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.73 
 
 		 283 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>