More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2817 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  100 
 
 		 378 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  80.76 
 
 		 380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  74.18 
 
 		 385 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  73.83 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  72.08 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  65.06 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  63.91 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  60.17 
 
 		 409 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.77 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  52.21 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.28 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.28 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  51.42 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  49.86 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  48.95 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  46.74 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.52 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  46.4 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  46.94 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  46.28 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  46.83 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  46.28 
 
 		 382 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  47.25 
 
 		 433 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  46.15 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  47.02 
 
 		 428 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.09 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  47.01 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.32 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.3 
 
 		 381 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.03 
 
 		 381 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  45.03 
 
 		 381 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.31 
 
 		 412 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  45.48 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  48.07 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.59 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.06 
 
 		 395 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  43.06 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  46.75 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.02 
 
 		 422 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  46.87 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.89 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  45.19 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  46.26 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  45.98 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  45.98 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.98 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  44.69 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  45.98 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  45.98 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  43.06 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  44.69 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  45.71 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  46.45 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  46.45 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  42.98 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  46.45 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  44.41 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.57 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  44.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  45.71 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  45.71 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 386 aa  275  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  47.38 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  46.52 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  44.05 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  45.56 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  48.1 
 
 		 400 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.27 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  50.29 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  42.97 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  40.67 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  40.67 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  40.67 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  44.57 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  44.77 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.15 
 
 		 391 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  43.72 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  49.85 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  44.51 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  47.32 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  44.29 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.54 
 
 		 397 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  44.59 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  44 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  43.96 
 
 		 420 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  43.96 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  45.1 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  45.1 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  46.52 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  45.1 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>