229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48043 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  59.17 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  51.38 
 
 		 373 aa  128  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  43.59 
 
 		 125 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  42.4 
 
 		 122 aa  108  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  37.33 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  41.67 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  37.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  41.1 
 
 		 104 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 125 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  40.28 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  30.14 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  34.72 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 101 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  36 
 
 		 97 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 99 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 88 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 102 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 		 82 aa  54.7  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.43 
 
 		 86 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  32.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 103 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  28.74 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 89 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 85 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  31.51 
 
 		 103 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 87 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 94 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 94 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 		 89 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  27.27 
 
 		 547 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 98 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 96 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 98 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 89 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 104 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 95 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  27.59 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 86 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 88 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 88 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  43.48 
 
 		 97 aa  51.6  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 111 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 88 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 91 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  28.72 
 
 		 104 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30.67 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  27.06 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 90 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  27.27 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  33.33 
 
 		 552 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 		 99 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  36.11 
 
 		 95 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 87 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  31.4 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  34.21 
 
 		 446 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 105 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 		 102 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  34.48 
 
 		 481 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  27.27 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>