86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39616 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.312591 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05268  conserved hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321428  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  31.78 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  22.75 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 		 122 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  23.97 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  37.18 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 		 85 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  31.82 
 
 		 112 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  31.87 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  31.82 
 
 		 107 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  32.61 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  25.1 
 
 		 632 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  34.94 
 
 		 109 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 104 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  26.77 
 
 		 724 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  33.73 
 
 		 95 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  32.95 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  26.44 
 
 		 95 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.41 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 92 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 94 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 92 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 94 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  27.14 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  35.29 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  36.56 
 
 		 86 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 101 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  21.54 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.63 
 
 		 97 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  28.4 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 		 149 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  27.95 
 
 		 1290 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  25 
 
 		 424 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  28.83 
 
 		 837 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 		 115 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  25.48 
 
 		 870 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  31.46 
 
 		 364 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 		 96 aa  45.4  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  25.95 
 
 		 449 aa  45.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  33.72 
 
 		 102 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  36.59 
 
 		 497 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.53 
 
 		 89 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  29.07 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  34.15 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2998  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 		 90 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  30.53 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  33.73 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 90 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30.11 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  34.94 
 
 		 95 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  30.95 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  30.11 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.79 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  28.28 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  33.7 
 
 		 455 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.73 
 
 		 82 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  22.66 
 
 		 673 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 117 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  36.05 
 
 		 874 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07935  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  26.88 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  34.94 
 
 		 95 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  26.81 
 
 		 838 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 110 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.74 
 
 		 552 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  28.71 
 
 		 97 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  33.33 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  23.11 
 
 		 572 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  34.15 
 
 		 119 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  29.47 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 157 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  32.26 
 
 		 162 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  26.43 
 
 		 223 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 99 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>