56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33791 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  100 
 
 		 381 aa  787    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  59.36 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  49.21 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  63.64 
 
 		 453 aa  343  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  44.86 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  39.67 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  41.16 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  40.24 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  40.11 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  39.55 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  38.44 
 
 		 346 aa  234  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  39.55 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  35.31 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  38.18 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  38.02 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  36.28 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  37.27 
 
 		 336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  36.75 
 
 		 326 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  38.96 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  37.04 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  37.16 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  38.24 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  40 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  36.86 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  35.81 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  36.14 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  36.19 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  33.52 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  36.5 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  31.19 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  32.48 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  31.96 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  27.96 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  28.96 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  28.63 
 
 		 1141 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.44 
 
 		 676 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  30.33 
 
 		 761 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  26.09 
 
 		 992 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.21 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  25.98 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  25.58 
 
 		 1323 aa  73.2  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  28.08 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  23.4 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  34.58 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  26.01 
 
 		 1012 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  22.02 
 
 		 822 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  23.63 
 
 		 894 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 896 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  35.19 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  23.14 
 
 		 894 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 866 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 866 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  30.5 
 
 		 886 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  23.1 
 
 		 794 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.4 
 
 		 879 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 888 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>