More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32724 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_32724  predicted protein  100 
 
 		 569 aa  1158    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  41.65 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  43.68 
 
 		 622 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30992  ethionine resistance protein  43.67 
 
 		 589 aa  364  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.628726 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54310  predicted protein  38.45 
 
 		 606 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0389645 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06870  MATE efflux family protein (Eurofung)  33.53 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03760  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  25.92 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  26.13 
 
 		 455 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 460 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.91 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.77 
 
 		 452 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 453 aa  127  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  25.51 
 
 		 452 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  25.06 
 
 		 460 aa  124  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  23.96 
 
 		 457 aa  124  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  24.65 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  23.73 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  23.73 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  25.46 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  24.76 
 
 		 453 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  23.17 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  23.79 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  25.34 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  23.62 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  24.14 
 
 		 477 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  24.14 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  23.4 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  22.83 
 
 		 457 aa  114  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47105  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.26 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  22 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  24.36 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 458 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  23.18 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  22.22 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  23.86 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  25.84 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 446 aa  109  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2428  multidrug resistance protein NorM, putative  24.94 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00757728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  24.37 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  23.13 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  21.58 
 
 		 458 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  21.4 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  22.3 
 
 		 457 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3441  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.67 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  25.62 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  25.62 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  25.62 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  25.62 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  25.62 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  25.56 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 464 aa  104  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48159  predicted protein  28.49 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35296  predicted protein  27.3 
 
 		 457 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  25.39 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  24.77 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  25.77 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  21.81 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  25.76 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.09 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  21.45 
 
 		 458 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 442 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 451 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  22.48 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  22.48 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 451 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  20.83 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  22.48 
 
 		 457 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  21.38 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  21.38 
 
 		 457 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  21.38 
 
 		 457 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  21.38 
 
 		 457 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>