238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9446 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  100 
 
 
220 aa  461  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  38.46 
 
 
246 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  38.46 
 
 
246 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53251  tRNA methyltransferase, has a role in tRNA modification  29.55 
 
 
259 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26394 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  37.28 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00280  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  24.23 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.69 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  24.76 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  27.2 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.41 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  25 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08050  methyltransferase family protein  26.89 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  hitchhiker  0.0000000452502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
235 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
259 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  32.23 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.28 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  25.62 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  27.22 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0468  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  23.96 
 
 
246 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  32.38 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  30.91 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  22.76 
 
 
267 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
265 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.52 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 
382 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
348 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.63 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.09 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.31 
 
 
263 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
215 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  30 
 
 
279 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  26.56 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
363 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
457 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
274 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
363 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  23.13 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.32 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  40 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  22.58 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>