74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53251 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53251  tRNA methyltransferase, has a role in tRNA modification  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26394 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  44.05 
 
 
228 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00280  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  136  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173894  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  33.73 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  33.73 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  29.55 
 
 
220 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3224  Methyltransferase type 11  21.37 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  29.84 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.42 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  34 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0994  methyltransferase type 11  23.5 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.430888 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.41 
 
 
201 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  29.41 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
212 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.37 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
314 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.89 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
399 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
339 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
320 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  29.61 
 
 
621 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  28.68 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.84 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  30 
 
 
331 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.19 
 
 
395 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.2 
 
 
399 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  32.39 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  28.24 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.79 
 
 
351 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
310 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
328 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
328 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
328 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.64 
 
 
414 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.85 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
236 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  29.03 
 
 
203 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  28.87 
 
 
327 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>