More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48190 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  100 
 
 
780 aa  1623    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.22 
 
 
689 aa  623  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.92 
 
 
689 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.81 
 
 
687 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.42 
 
 
687 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.39 
 
 
695 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  47.6 
 
 
694 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  47.26 
 
 
685 aa  592  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.52 
 
 
695 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.68 
 
 
689 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.61 
 
 
683 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.32 
 
 
699 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.62 
 
 
696 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.28 
 
 
696 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.17 
 
 
682 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.99 
 
 
717 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.04 
 
 
682 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  44.57 
 
 
693 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.6 
 
 
699 aa  568  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.48 
 
 
716 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.44 
 
 
694 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.65 
 
 
696 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.85 
 
 
717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.28 
 
 
733 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.6 
 
 
699 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.06 
 
 
681 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.17 
 
 
696 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  43.95 
 
 
692 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.75 
 
 
671 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.85 
 
 
672 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.7 
 
 
674 aa  525  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.41 
 
 
672 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.56 
 
 
672 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0332  M3 family peptidase  42.52 
 
 
674 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.39 
 
 
714 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.74 
 
 
848 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.57 
 
 
678 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.14 
 
 
729 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.9 
 
 
729 aa  491  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.28 
 
 
730 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2973  peptidyl-dipeptidase  43.77 
 
 
673 aa  485  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.51 
 
 
728 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.02 
 
 
727 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1608  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.41 
 
 
687 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.39 
 
 
725 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4267  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.35 
 
 
746 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.28 
 
 
726 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.28 
 
 
736 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.86 
 
 
726 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.87 
 
 
726 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0143  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.88 
 
 
734 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.62915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.8 
 
 
742 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.25 
 
 
742 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.66 
 
 
742 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.4 
 
 
734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.54 
 
 
734 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.4 
 
 
734 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.78 
 
 
716 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  35.4 
 
 
734 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.24 
 
 
718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.35 
 
 
716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.79 
 
 
722 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.43 
 
 
716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.13 
 
 
716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.13 
 
 
716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.59 
 
 
716 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.73 
 
 
716 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.49 
 
 
716 aa  446  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.76 
 
 
717 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.83 
 
 
711 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  38.18 
 
 
722 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.24 
 
 
683 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.05 
 
 
712 aa  436  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.66 
 
 
714 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.78 
 
 
712 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  36.78 
 
 
675 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.27 
 
 
718 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.34 
 
 
716 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.99 
 
 
659 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.51 
 
 
723 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.2 
 
 
718 aa  422  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.16 
 
 
720 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.3 
 
 
723 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.7 
 
 
718 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.5 
 
 
677 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.12 
 
 
714 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.43 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.98 
 
 
714 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.62 
 
 
716 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.32 
 
 
714 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.32 
 
 
714 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.43 
 
 
733 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  34.38 
 
 
709 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  35.43 
 
 
671 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.73 
 
 
715 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.96 
 
 
655 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.58 
 
 
715 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.58 
 
 
715 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.66 
 
 
711 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.46 
 
 
726 aa  402  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>