More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4266 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_4266  predicted protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
335 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000012318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
324 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29217  predicted protein  28.52 
 
 
393 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
315 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
340 aa  99  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
288 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
320 aa  98.6  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  32.89 
 
 
306 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
312 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
288 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  33.33 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.52 
 
 
301 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  29.58 
 
 
302 aa  92  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
312 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
324 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.58 
 
 
300 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
289 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.92 
 
 
329 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  30.92 
 
 
333 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  30.92 
 
 
329 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.92 
 
 
328 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
305 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  28.64 
 
 
300 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  29.11 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81469  short-chain alcohol dehydrogenase retinol dehydrogenase Protochlorophyllide reductase  28.64 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.761909  normal  0.570556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  27.67 
 
 
308 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.655349  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  27.2 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
297 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
317 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  27.38 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  28.71 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08603  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  29.33 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 
303 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  28.23 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  27.31 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  27.91 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  27.91 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.36 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  27.7 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  28.3 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 
308 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>