More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32758 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32758  predicted protein  100 
 
 
483 aa  982    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81007  predicted protein  41.52 
 
 
558 aa  329  5.0000000000000004e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.661709  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30562  predicted protein  41.98 
 
 
474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.387537 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03650  ATP dependent RNA helicase, putative  32.18 
 
 
620 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.44 
 
 
456 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.54 
 
 
462 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.14 
 
 
473 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.82 
 
 
454 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.82 
 
 
454 aa  209  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  33.82 
 
 
454 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.82 
 
 
454 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.82 
 
 
454 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  33.82 
 
 
454 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.82 
 
 
455 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.82 
 
 
454 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  34.15 
 
 
398 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2004  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.35 
 
 
467 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0563026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.57 
 
 
454 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
467 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  32.77 
 
 
495 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1989  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.35 
 
 
467 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2052  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 
467 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15758  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 
519 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.66 
 
 
519 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.99 
 
 
485 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
465 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1884  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
488 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.972108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.6 
 
 
468 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
467 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.82 
 
 
501 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
504 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2571  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.78 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1018  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.68 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338708  normal  0.0711537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.78 
 
 
487 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337747  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  32.59 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2168  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.78 
 
 
487 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177474  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.8 
 
 
463 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  32.05 
 
 
503 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.52 
 
 
578 aa  199  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0838  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  33.41 
 
 
403 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794098  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  32.45 
 
 
478 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31 
 
 
477 aa  199  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.41 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.01 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.04 
 
 
535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.7 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0383  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.25 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
423 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.8 
 
 
426 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
549 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.45 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 
537 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.14 
 
 
456 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  29.78 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  32.52 
 
 
398 aa  196  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 
381 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
525 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  33.42 
 
 
394 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12981  predicted protein  34.22 
 
 
462 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  31.39 
 
 
516 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
525 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
526 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  32.93 
 
 
799 aa  196  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.78 
 
 
448 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
491 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
494 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.95 
 
 
515 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.87 
 
 
427 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.23 
 
 
466 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.49 
 
 
383 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
550 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.1 
 
 
414 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.1 
 
 
508 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.33 
 
 
476 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 
482 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.19 
 
 
515 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.19 
 
 
515 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  31.72 
 
 
500 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.69 
 
 
484 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  34.98 
 
 
738 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  32.05 
 
 
481 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 
471 aa  194  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01634  Pre-mRNA-splicing ATP-dependent RNA helicase prp28 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCU6]  33 
 
 
782 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  32.05 
 
 
482 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.53 
 
 
425 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.86 
 
 
507 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.71 
 
 
451 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  29.98 
 
 
516 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  32.05 
 
 
482 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>