167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0508 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  37.76 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.85 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  37 
 
 		 357 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  36.5 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  36.5 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  37.81 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.03 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.47 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  36 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  30.85 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  34 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  35.82 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  34 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  30.32 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  31.12 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  31.47 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  28.87 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  22.75 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.67 
 
 		 768 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  26.42 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.69 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.32 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.95 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  26.15 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2094  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.07906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  26.02 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  38.53 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  29.84 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  31.66 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  35.04 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  25.87 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  36.11 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 750 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.87 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  26.83 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.33 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.55 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3299  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0438  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.91 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  33.91 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.41 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0125  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  28.21 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.87 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  28.5 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  27.54 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  27.04 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.75 
 
 		 493 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  29.53 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3259  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.11 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.89 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 819 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.9 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  29.53 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.5 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  30.56 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5696  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0878159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>