More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1732 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 641 aa  1310    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  45.72 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  31.32 
 
 		 589 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  30.34 
 
 		 587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 		 610 aa  230  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 606 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 578 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 602 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 652 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 596 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.94 
 
 		 595 aa  150  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  35.71 
 
 		 248 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  23.35 
 
 		 599 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  24.92 
 
 		 589 aa  141  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  25.04 
 
 		 604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 596 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.32 
 
 		 218 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  34.88 
 
 		 239 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 		 581 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24 
 
 		 589 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25.24 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 		 574 aa  117  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  28.18 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  23.53 
 
 		 504 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.73 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  49.15 
 
 		 247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.32 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.99 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 226 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  23.97 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  24.2 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  26.43 
 
 		 617 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 599 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  23.76 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  22.45 
 
 		 599 aa  89.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 229 aa  87.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  21.85 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.83 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  22.77 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  23.01 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  28.89 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  22.18 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  22.18 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  39.67 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  23.2 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  29.52 
 
 		 275 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  25.13 
 
 		 270 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  36.61 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  24.2 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  20.9 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  21.61 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  21.88 
 
 		 612 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.18 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  34.51 
 
 		 216 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  25.64 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 782 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  27.57 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  24.11 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  25.86 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  21.7 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  25.86 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  22.74 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  25.42 
 
 		 676 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  21.89 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  39.45 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  22.92 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  22.22 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  42.65 
 
 		 811 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  43.06 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  22.66 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  26.38 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  43.06 
 
 		 694 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  22.28 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  29.71 
 
 		 1006 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  42.65 
 
 		 1094 aa  61.6  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  41.67 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  21.94 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  21.26 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  22.68 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  23.21 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  23.78 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  23.24 
 
 		 735 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  22.97 
 
 		 753 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  25.38 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>