More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1039 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1039  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
280 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2898  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.69 
 
 
273 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.67 
 
 
267 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1552  trypsin-like serine protease, putative  33.49 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159955  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3046  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.68 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.933946  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1423  WD-40 repeat-containing protein  36 
 
 
239 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 
542 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  36.87 
 
 
578 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2049  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.34 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.718333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.62 
 
 
539 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2330  hypothetical protein  30.37 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2279  WD-40 repeat-containing protein  30.37 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.92 
 
 
706 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.6 
 
 
706 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3646  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
472 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.307006  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.88 
 
 
582 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  33.17 
 
 
581 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 
508 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1645  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.66 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.773574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2300  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.68 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28631  hypothetical protein  27.78 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  31.82 
 
 
385 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.7 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  31.66 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.17 
 
 
464 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  30.22 
 
 
474 aa  68.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  31.25 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5157  hypothetical protein  25.88 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000004071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  32.18 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  34.81 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  28.99 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  28.21 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  30.64 
 
 
498 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
424 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  28.98 
 
 
489 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  30.48 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  30.11 
 
 
522 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  32.35 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  32.02 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  30.68 
 
 
497 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  28.5 
 
 
501 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  27.39 
 
 
396 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  30.11 
 
 
511 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0176  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.610666  normal  0.201691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  31.25 
 
 
496 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  29.67 
 
 
374 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  27.75 
 
 
483 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  29.55 
 
 
511 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 
640 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  35.29 
 
 
477 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  27.75 
 
 
483 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  29.55 
 
 
511 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  32.58 
 
 
392 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  27.37 
 
 
487 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  32.58 
 
 
392 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  31.28 
 
 
365 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.32 
 
 
425 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  30.3 
 
 
594 aa  63.2  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  33.5 
 
 
407 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  33.53 
 
 
502 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  32.37 
 
 
457 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  30.32 
 
 
485 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  32.37 
 
 
457 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.59 
 
 
464 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  32.37 
 
 
463 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  31.79 
 
 
467 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  31.43 
 
 
473 aa  62.4  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.28 
 
 
820 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 
417 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  30.53 
 
 
503 aa  62.4  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  30.77 
 
 
500 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  29.79 
 
 
477 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  29.94 
 
 
474 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  34.36 
 
 
409 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  30.11 
 
 
465 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  29.19 
 
 
502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  29.17 
 
 
575 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  28.27 
 
 
487 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  29.79 
 
 
485 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  28.9 
 
 
483 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.39 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  31.95 
 
 
475 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.22 
 
 
366 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  30.11 
 
 
514 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  31.21 
 
 
456 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  30.73 
 
 
458 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6024  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 
390 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  30.68 
 
 
498 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.33 
 
 
401 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  32.95 
 
 
456 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  31.79 
 
 
456 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 
428 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  33.72 
 
 
481 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  30.57 
 
 
411 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  33.72 
 
 
481 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  30.3 
 
 
472 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>