More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0291 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
412 aa  839    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.03 
 
 
542 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
410 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.2 
 
 
581 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
649 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.82 
 
 
706 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.39 
 
 
539 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.42 
 
 
706 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.09 
 
 
582 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 
508 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  35.17 
 
 
578 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
512 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1645  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
264 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.773574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2279  WD-40 repeat-containing protein  33.48 
 
 
240 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2049  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.15 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.718333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2330  hypothetical protein  33.04 
 
 
240 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.78 
 
 
267 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2898  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.34 
 
 
273 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  27.23 
 
 
623 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.77 
 
 
820 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  29.58 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1423  WD-40 repeat-containing protein  28.89 
 
 
239 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1039  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  30.15 
 
 
600 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3646  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.307006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
547 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3046  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
284 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.933946  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.87 
 
 
462 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1552  trypsin-like serine protease, putative  29.89 
 
 
285 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159955  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  30.72 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
605 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
674 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  30.72 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
169 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.19 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  35 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
746 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  33.73 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 
878 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.77 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.94 
 
 
464 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  32.29 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  26.56 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28631  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  30.72 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.73 
 
 
464 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  33.33 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2050  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.737754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.94 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  28.57 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.52 
 
 
483 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.52 
 
 
483 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  31.09 
 
 
492 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.33 
 
 
476 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
292 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  29.35 
 
 
495 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  30.91 
 
 
475 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 
237 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  28.8 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 
524 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.97 
 
 
502 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  32.12 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  28.8 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  34.34 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  28.8 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  28.8 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  28.8 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  28.8 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  28.8 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.39 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  32.03 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  29.33 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
280 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 
363 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.38 
 
 
515 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.3 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  29.33 
 
 
506 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  32.24 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  30.06 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  30.46 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  31.37 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  31.79 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  32.24 
 
 
484 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  29.03 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  30.77 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.3 
 
 
457 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  31.37 
 
 
469 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  31.37 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  29.41 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>