27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5157 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5157  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000004071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 
578 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1423  WD-40 repeat-containing protein  27.32 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1039  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.34 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2898  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.84 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.03 
 
 
581 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.69 
 
 
706 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  26.7 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.57 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.79 
 
 
582 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  22.75 
 
 
508 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2279  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2330  hypothetical protein  26.78 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1552  trypsin-like serine protease, putative  23.94 
 
 
285 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159955  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
412 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3046  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.24 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.933946  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1645  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.773574 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.44 
 
 
507 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 
526 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.04 
 
 
558 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3646  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
472 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.307006  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.04 
 
 
558 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.56 
 
 
497 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0997  FHA domain-containing protein  30.3 
 
 
603 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>