232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0997 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0997  FHA domain-containing protein  100 
 
 
603 aa  1223    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  45.26 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  46.74 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.87 
 
 
497 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  37.39 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.65 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.82 
 
 
480 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  31.16 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.84 
 
 
537 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  47.56 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  31.16 
 
 
347 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  34.03 
 
 
364 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0405  FHA domain containing protein  38.2 
 
 
490 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.87 
 
 
464 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  29.41 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.54 
 
 
464 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  30.66 
 
 
341 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 
116 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 
152 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.96 
 
 
1004 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  31.76 
 
 
382 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.22 
 
 
307 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  37.63 
 
 
234 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4924  FHA domain-containing protein  36.14 
 
 
234 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  31.21 
 
 
360 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  44.3 
 
 
946 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 
374 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.03 
 
 
264 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  29.01 
 
 
478 aa  51.6  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  30.08 
 
 
499 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  27.17 
 
 
397 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  29.56 
 
 
492 aa  51.2  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  27.17 
 
 
397 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  27.78 
 
 
383 aa  51.6  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.94 
 
 
399 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 
379 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 
1065 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  47.62 
 
 
253 aa  50.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  28.74 
 
 
473 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  30.06 
 
 
365 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  31.58 
 
 
673 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  30.77 
 
 
467 aa  50.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 
311 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  32.35 
 
 
594 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
188 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  27.85 
 
 
453 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
1011 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.59 
 
 
334 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 
225 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  29.33 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  25.62 
 
 
525 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  26.38 
 
 
308 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  32.39 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 
621 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  43.84 
 
 
863 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  27.41 
 
 
485 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  28.75 
 
 
363 aa  48.9  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  27.44 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  30.18 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  31.54 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.88 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  31.69 
 
 
493 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  29.81 
 
 
351 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  27.61 
 
 
481 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  28.57 
 
 
482 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.29 
 
 
458 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  31.69 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
497 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  28.89 
 
 
487 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  29.66 
 
 
368 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.41 
 
 
473 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  32.03 
 
 
461 aa  48.5  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  26.67 
 
 
478 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.59 
 
 
556 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.43 
 
 
502 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
496 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.97 
 
 
368 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1396  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.48 
 
 
441 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  26.99 
 
 
473 aa  48.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  29.25 
 
 
477 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  29.25 
 
 
477 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.29 
 
 
457 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  29.17 
 
 
491 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  39.44 
 
 
167 aa  48.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  29.17 
 
 
479 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  32.17 
 
 
385 aa  47.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  27.84 
 
 
385 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  29.22 
 
 
469 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.39 
 
 
504 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  27.13 
 
 
443 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.99 
 
 
507 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  29.81 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  28.75 
 
 
473 aa  47.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  29.81 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  26.43 
 
 
475 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  29.81 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>