62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0772 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0772  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 636 aa  1293    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  49.52 
 
 		 613 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  49.2 
 
 		 613 aa  595  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  49.28 
 
 		 603 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  49.28 
 
 		 603 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2275  TPR repeat-containing protein  47.61 
 
 		 628 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 782 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.5 
 
 		 1266 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.3 
 
 		 985 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 991 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1060 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.06 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 		 828 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.92 
 
 		 941 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1101 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1313 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.31 
 
 		 957 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.81 
 
 		 1009 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1063 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1298 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.94 
 
 		 1020 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  23.61 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.89 
 
 		 1468 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 1279 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.75 
 
 		 725 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.23 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.77 
 
 		 609 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.07 
 
 		 809 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1048 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  25.71 
 
 		 928 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 923 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 412 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 850 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  22.07 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1550 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  25.24 
 
 		 695 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.97 
 
 		 992 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1916  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1172 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.506674  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1025 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 571 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3789  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  23.53 
 
 		 340 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  22.27 
 
 		 990 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1596 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.43 
 
 		 1147 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  27.66 
 
 		 991 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 1195 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  22.99 
 
 		 621 aa  44.3  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  28.36 
 
 		 931 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 962 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  24.59 
 
 		 946 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  22.33 
 
 		 928 aa  43.9  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>