141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3336 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  100 
 
 		 249 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  91.8 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  75.54 
 
 		 237 aa  358  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  76.05 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  63.87 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  61.76 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  61.76 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  61.76 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  61.76 
 
 		 232 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  61.76 
 
 		 232 aa  297  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  61.76 
 
 		 232 aa  297  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  61.34 
 
 		 232 aa  295  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  61.34 
 
 		 232 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  61.34 
 
 		 232 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  63.35 
 
 		 226 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  63.35 
 
 		 226 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  62.9 
 
 		 226 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  62.44 
 
 		 226 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  66.97 
 
 		 249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  66.97 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  63.01 
 
 		 226 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  66.67 
 
 		 228 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  59.66 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  51.11 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  51.63 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  51.63 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  51.63 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  51.56 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  51.16 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  49.3 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  50.93 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  49.78 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  47.21 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  49.78 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  46.38 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  46.58 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  46.58 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  46.58 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  50 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  46.78 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  45.26 
 
 		 230 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  50.87 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  46.03 
 
 		 281 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  46.58 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  46.35 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  46.35 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  44.91 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  47.14 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  45.92 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  50.86 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  48.62 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  49.58 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  40.69 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  43.59 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  41.32 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  44.93 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  43.42 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  42.61 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  44.14 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  40.09 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  40.91 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  40.09 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  42.24 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  46.67 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  39.01 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  35.29 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  37.57 
 
 		 194 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  33.69 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  34.62 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  34.3 
 
 		 171 aa  88.6  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  35 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  35 
 
 		 199 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  34.64 
 
 		 199 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  36.42 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  37.82 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  34.59 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  33.54 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  31.61 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  32.96 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  28.66 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  33.52 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  28.89 
 
 		 179 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  31.87 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  25.67 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  29.05 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  28.79 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  28.22 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  31.52 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  28.89 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  32.3 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  30.07 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  31.69 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>