More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  96.6 
 
 		 206 aa  350  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  63.16 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  34.91 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  36.13 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.89 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  23.91 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.97 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  26.98 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.01 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  26.98 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  27.95 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  28.99 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.05 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  26.49 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.05 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.77 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.77 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  37.13 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.77 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  29.69 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  29.76 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  27.7 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  27.19 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.3 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  28.3 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  27.44 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.44 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  37.38 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.88 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.17 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.17 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.17 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.17 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.17 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.72 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.14 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  29.13 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  29.35 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  25.25 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  25.28 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  24.47 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  26.58 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  22.46 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  26.74 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  26.9 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  29.05 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.63 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  36.55 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  31.02 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>