More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  96.31 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  69.04 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  62.32 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  63.82 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  64.14 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.56 
 
 		 381 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.78 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.89 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 		 493 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.2 
 
 		 489 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.73 
 
 		 449 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  35.02 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 567 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.32 
 
 		 441 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 389 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.59 
 
 		 903 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.45 
 
 		 745 aa  91.3  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 		 333 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.97 
 
 		 319 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 343 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.49 
 
 		 448 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  43.9 
 
 		 332 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 343 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 		 277 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 		 351 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 336 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 336 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.78 
 
 		 340 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.52 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 		 576 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.8 
 
 		 386 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.41 
 
 		 440 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.32 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 		 266 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.76 
 
 		 517 aa  85.1  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.64 
 
 		 521 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.94 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  36.16 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.78 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  37.08 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.89 
 
 		 416 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  42.03 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.5 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  44.2 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  36.26 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 		 727 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.12 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  39.35 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.44 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.84 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 		 446 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.26 
 
 		 447 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 862 aa  79  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.2 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.84 
 
 		 401 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.67 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  40.99 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  41.33 
 
 		 1191 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>