94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18941 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  100 
 
 
360 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  62.4 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  63.23 
 
 
360 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  64.07 
 
 
360 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  34.51 
 
 
370 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
368 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  32.51 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.28 
 
 
372 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  27.4 
 
 
350 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  29.19 
 
 
302 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
366 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
389 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  23.65 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.43 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.16 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.16 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.13 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  24 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.89 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.89 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.93 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.93 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.59 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  23.23 
 
 
666 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  19.39 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 
666 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  23.86 
 
 
375 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  23.56 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.8 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 
652 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  19.47 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  21.43 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  18.63 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  22.32 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  22.32 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  20.17 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  20.83 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  21.41 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  20.38 
 
 
375 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  20.34 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  20.39 
 
 
369 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  20.23 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  19.83 
 
 
405 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  20 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  23.24 
 
 
360 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  20.85 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  19.67 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  19.74 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  19.35 
 
 
371 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  19.03 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  21.39 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.78 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  20.47 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  19.53 
 
 
960 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  20.92 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  20.11 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  20.72 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.45 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  21.2 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  19.5 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
365 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  20.57 
 
 
491 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.2 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  20.93 
 
 
417 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  24.22 
 
 
682 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.2 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  20.89 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3577  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  20 
 
 
622 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.34 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  20.16 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  19.68 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  19.12 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2044  FAD dependent oxidoreductase  18.98 
 
 
300 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 
390 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  22.62 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  18.52 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
354 aa  43.1  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1124  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.25 
 
 
411 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>