More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_07791 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  82.04 
 
 
217 aa  361  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  80.58 
 
 
217 aa  355  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  80.58 
 
 
217 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  72.69 
 
 
217 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  72.69 
 
 
217 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  66.03 
 
 
217 aa  300  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  59.45 
 
 
217 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  63.43 
 
 
217 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  59.26 
 
 
217 aa  294  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  58.33 
 
 
216 aa  284  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  62.2 
 
 
227 aa  278  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  57.35 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  52.15 
 
 
220 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  53.52 
 
 
237 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.59 
 
 
209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.41 
 
 
218 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  53.43 
 
 
212 aa  234  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.75 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  46.07 
 
 
218 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  45.79 
 
 
261 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  44.27 
 
 
248 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.15 
 
 
211 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  42.71 
 
 
252 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  43.75 
 
 
260 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  40.61 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  46.15 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  43 
 
 
212 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.86 
 
 
219 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 
219 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  43.01 
 
 
254 aa  164  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  42.57 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  42.42 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  41.5 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.26 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.56 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  42.71 
 
 
222 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  42.71 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  42.19 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  40.91 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.41 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.05 
 
 
212 aa  161  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  43.07 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  42.57 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  40.7 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  41.88 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  38.32 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  41.75 
 
 
233 aa  161  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  43.01 
 
 
219 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.89 
 
 
214 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  42.57 
 
 
212 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  43.85 
 
 
254 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.41 
 
 
247 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  40.91 
 
 
260 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  41.58 
 
 
287 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  41.58 
 
 
212 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  41.5 
 
 
236 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  40.89 
 
 
214 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  43.68 
 
 
256 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  42.08 
 
 
212 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  44.39 
 
 
210 aa  159  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  43.07 
 
 
335 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  40.5 
 
 
219 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  44.44 
 
 
213 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  41.09 
 
 
230 aa  158  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  41.75 
 
 
219 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  40.82 
 
 
207 aa  158  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  41.75 
 
 
219 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  41.58 
 
 
209 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  40 
 
 
236 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  44.5 
 
 
210 aa  157  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  40 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  40.84 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.07 
 
 
212 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  40 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  41.58 
 
 
209 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.32 
 
 
274 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  38.46 
 
 
215 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  42.08 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.11 
 
 
223 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.5 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.84 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  42.5 
 
 
211 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.78 
 
 
268 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  40.31 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  40.59 
 
 
248 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  41.36 
 
 
214 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  39.29 
 
 
211 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.88 
 
 
211 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.42 
 
 
218 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0246  endonuclease III  40.84 
 
 
216 aa  155  4e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00760265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  42 
 
 
211 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.74 
 
 
219 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>