More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01161 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  40.13 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
337 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
326 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  32.49 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  29.17 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
316 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  28.57 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  31.13 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  27.5 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  28.39 
 
 
301 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  29.07 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  26.9 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
345 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.15 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  21.69 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
311 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.07 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.09 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  23.8 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  24.23 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  22.64 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  23.9 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  23.75 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  23.41 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  24.63 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  22.45 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  22.02 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.05 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.7 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  23.2 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.6 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.55 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.14 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  22.94 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  22.42 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  21.7 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  22.12 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  22.77 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  22.36 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  22.45 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  21.22 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  25.14 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.16 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  22.22 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  26.86 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  23.15 
 
 
345 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  25.7 
 
 
398 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  21.62 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  24.04 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  23.41 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.6 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.31 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.42 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.42 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
382 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  23.02 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  22.54 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>