More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3219 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  100 
 
 		 905 aa  1862    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.26 
 
 		 712 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  42.27 
 
 		 717 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  43.76 
 
 		 733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.4 
 
 		 762 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  52.53 
 
 		 904 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  48.18 
 
 		 881 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  48.1 
 
 		 893 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  47.47 
 
 		 875 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.74 
 
 		 756 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 		 1212 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.93 
 
 		 778 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 		 778 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.56 
 
 		 1343 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  47.86 
 
 		 902 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 		 1357 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  34.08 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.63 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  45.8 
 
 		 889 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.16 
 
 		 734 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  31.87 
 
 		 1548 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.81 
 
 		 777 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.77 
 
 		 859 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 		 766 aa  361  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.38 
 
 		 772 aa  361  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  46.67 
 
 		 882 aa  360  9e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.74 
 
 		 799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.4 
 
 		 801 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  47.64 
 
 		 882 aa  357  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.24 
 
 		 765 aa  355  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 		 772 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.24 
 
 		 755 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.1 
 
 		 755 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  33.38 
 
 		 765 aa  353  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.38 
 
 		 765 aa  353  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 		 765 aa  353  8.999999999999999e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  33.38 
 
 		 765 aa  353  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 		 765 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  33.57 
 
 		 765 aa  353  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  33.52 
 
 		 765 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.1 
 
 		 755 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.1 
 
 		 755 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  33.38 
 
 		 765 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 738 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  35.92 
 
 		 790 aa  348  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.76 
 
 		 769 aa  348  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  33.24 
 
 		 765 aa  348  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 		 792 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.7 
 
 		 763 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.9 
 
 		 763 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.58 
 
 		 763 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.9 
 
 		 757 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  33.66 
 
 		 803 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.76 
 
 		 763 aa  340  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 763 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.51 
 
 		 768 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  37.05 
 
 		 763 aa  337  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 		 769 aa  337  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.53 
 
 		 766 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.16 
 
 		 774 aa  337  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.13 
 
 		 782 aa  337  7e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.8 
 
 		 808 aa  336  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 		 751 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  35.7 
 
 		 864 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  32.9 
 
 		 764 aa  333  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33 
 
 		 765 aa  331  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.39 
 
 		 804 aa  331  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  46.73 
 
 		 849 aa  330  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 		 784 aa  330  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 768 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 753 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 738 aa  327  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.43 
 
 		 771 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  32.09 
 
 		 764 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.49 
 
 		 765 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.35 
 
 		 743 aa  324  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 		 745 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.28 
 
 		 768 aa  323  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.76 
 
 		 783 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.17 
 
 		 760 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.48 
 
 		 751 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.4 
 
 		 743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.97 
 
 		 1037 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.12 
 
 		 765 aa  313  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.53 
 
 		 750 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 		 754 aa  310  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 738 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  33.68 
 
 		 721 aa  308  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 		 724 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  44.63 
 
 		 898 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.27 
 
 		 795 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.14 
 
 		 755 aa  303  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 		 711 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 749 aa  301  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 		 765 aa  300  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 758 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 749 aa  299  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 760 aa  298  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>