More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0336 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
223 aa  433  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  51.83 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  52.31 
 
 
203 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  46.43 
 
 
198 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  55.79 
 
 
198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
198 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  44.39 
 
 
198 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  46.03 
 
 
196 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  46.03 
 
 
196 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  46.03 
 
 
196 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  44.92 
 
 
196 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  43.32 
 
 
196 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  46.02 
 
 
193 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  45.31 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 
198 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  46.94 
 
 
199 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  46.02 
 
 
193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
181 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  45.79 
 
 
197 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  56.52 
 
 
210 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 
199 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  46.52 
 
 
199 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 
199 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 
199 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 
199 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  43.08 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 
199 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  42.21 
 
 
200 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  38.78 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  41 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 
207 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 
181 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
231 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
231 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 
231 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  36.87 
 
 
181 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
182 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
181 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 
184 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 
231 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 
199 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 
199 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 
187 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 
182 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
187 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.43 
 
 
187 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
187 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
181 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.43 
 
 
187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  40 
 
 
181 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 
199 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
187 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  41.57 
 
 
182 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.99 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.99 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  38.58 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  36.61 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.24 
 
 
289 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
203 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 
184 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  43.17 
 
 
182 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  44.77 
 
 
190 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.3 
 
 
185 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  39.31 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 
187 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 
218 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 
186 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 
196 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  45.21 
 
 
190 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  43.09 
 
 
182 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
184 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
184 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  35.44 
 
 
316 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
185 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  35 
 
 
184 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
190 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  38.29 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 
244 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 
182 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
313 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
184 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 
182 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  34.44 
 
 
185 aa  98.2  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
342 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>