More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3003 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  90.28 
 
 		 288 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  90.62 
 
 		 288 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  61.32 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.04 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  56.45 
 
 		 316 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.69 
 
 		 315 aa  331  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  53.5 
 
 		 315 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 		 308 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.99 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  57.4 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  56.64 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  52.52 
 
 		 293 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  50 
 
 		 299 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  49.83 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  47.9 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  47.04 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  48.25 
 
 		 337 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  48.25 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  47.04 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  46.5 
 
 		 302 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  45.49 
 
 		 295 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  47.2 
 
 		 331 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  46.5 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  48.25 
 
 		 323 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  54.62 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  48.95 
 
 		 328 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.9 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  44.52 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  44.79 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  45.29 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  44.77 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  47.83 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  53.78 
 
 		 239 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  44.1 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  46.5 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  45.16 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 288 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  47.55 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  43.71 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  43.71 
 
 		 286 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  47.57 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  49.1 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  47.57 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  48.35 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  47.62 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  48.18 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  46.69 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  48.08 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  44.87 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  44.93 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  47.39 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.02 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  47.39 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  40.28 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  39.71 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  46.69 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  46.69 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  47.04 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  39.35 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  38.99 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.99 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  38.99 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  38.63 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  38.99 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  43.68 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  43.68 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.65 
 
 		 344 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  38.68 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  40.54 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  41.31 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>