More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33799 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33799  BCCT family transporter: glycine betaine/carnitine/choline  100 
 
 		 508 aa  1030    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_1494  BCCT family transporter: carnitine/choline  47.63 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.370102  normal  0.0552905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  36.66 
 
 		 659 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  36.66 
 
 		 659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  35.63 
 
 		 661 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  34.55 
 
 		 657 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  35.23 
 
 		 661 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  33.4 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 606 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  34.07 
 
 		 538 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  34.28 
 
 		 542 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  35.44 
 
 		 545 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.53 
 
 		 667 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  34.97 
 
 		 546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  34.46 
 
 		 549 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  34.42 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 550 aa  264  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  34.01 
 
 		 535 aa  263  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.15 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  34.97 
 
 		 660 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  33.13 
 
 		 681 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  32.16 
 
 		 530 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.57 
 
 		 526 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  34.25 
 
 		 687 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  33.13 
 
 		 676 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  34.07 
 
 		 681 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  34.66 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  31.91 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  33.06 
 
 		 646 aa  257  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.46 
 
 		 637 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  34.46 
 
 		 490 aa  256  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  34.2 
 
 		 676 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  33 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48315  predicted protein  31.63 
 
 		 831 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000929997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  35.29 
 
 		 667 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  35.29 
 
 		 667 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  35.51 
 
 		 664 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 660 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 662 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  35.29 
 
 		 667 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  32.86 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  32.86 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  32.86 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  35.29 
 
 		 667 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  32.86 
 
 		 676 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  32.86 
 
 		 676 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 658 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  33.94 
 
 		 658 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 658 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  32.86 
 
 		 716 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 658 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  32.86 
 
 		 716 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  32.15 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  32.74 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  33.89 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  31.5 
 
 		 583 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 550 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  32.59 
 
 		 668 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  32.49 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  31.84 
 
 		 573 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  30.6 
 
 		 555 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  32.95 
 
 		 554 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  33.96 
 
 		 498 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 682 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  32.44 
 
 		 523 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  33.06 
 
 		 603 aa  249  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  33.81 
 
 		 658 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  30.83 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  33.81 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  32.66 
 
 		 698 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  32.06 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  33.96 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 658 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  32.65 
 
 		 661 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  32.24 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  32.24 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 580 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  34.58 
 
 		 526 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  31.69 
 
 		 551 aa  246  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.64 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  31.07 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.64 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.64 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.64 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.64 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  31.57 
 
 		 658 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  30.99 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2505  choline/carnitine/betaine transporter  32.73 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  31.23 
 
 		 667 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  32.22 
 
 		 534 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  32.39 
 
 		 673 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 691 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  31.63 
 
 		 539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  31.23 
 
 		 667 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.43 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.43 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.43 
 
 		 504 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>