More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48315 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48315  predicted protein  100 
 
 		 831 aa  1701    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000929997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  32.84 
 
 		 526 aa  282  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  33.22 
 
 		 584 aa  276  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.79 
 
 		 551 aa  273  8.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  32.44 
 
 		 526 aa  270  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.86 
 
 		 567 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32.07 
 
 		 538 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.79 
 
 		 659 aa  265  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0433  transporter, BCCT family  31.22 
 
 		 531 aa  264  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.52 
 
 		 659 aa  262  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  30.69 
 
 		 540 aa  261  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  33.21 
 
 		 545 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_1494  BCCT family transporter: carnitine/choline  38.9 
 
 		 471 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.370102  normal  0.0552905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  31.44 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  31.65 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  34.19 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.18 
 
 		 553 aa  258  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  33.97 
 
 		 667 aa  258  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  33.51 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  34.09 
 
 		 524 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  30.52 
 
 		 523 aa  254  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  33.01 
 
 		 657 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  31.16 
 
 		 529 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.34 
 
 		 535 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  32.06 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 542 aa  251  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.83 
 
 		 606 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 		 529 aa  249  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  35.41 
 
 		 611 aa  248  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  34.2 
 
 		 656 aa  247  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  30.97 
 
 		 644 aa  247  6e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  32.89 
 
 		 550 aa  247  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  33.13 
 
 		 546 aa  247  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  34.24 
 
 		 603 aa  246  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  29.85 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  33.04 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  30.55 
 
 		 660 aa  245  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  33.91 
 
 		 661 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  33.91 
 
 		 661 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  30.25 
 
 		 535 aa  244  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  31.25 
 
 		 637 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  33.09 
 
 		 506 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  30.43 
 
 		 580 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  28.95 
 
 		 530 aa  241  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33799  BCCT family transporter: glycine betaine/carnitine/choline  34.01 
 
 		 508 aa  241  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  31.99 
 
 		 539 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  29.29 
 
 		 681 aa  241  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  30.16 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  31.98 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  30.17 
 
 		 681 aa  239  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  29.93 
 
 		 526 aa  238  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  30.96 
 
 		 490 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  30.89 
 
 		 682 aa  237  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  31.56 
 
 		 676 aa  237  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  31.8 
 
 		 541 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 582 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  32.86 
 
 		 606 aa  234  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003138  High-affinity choline uptake protein BetT  32 
 
 		 450 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000429409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  32.85 
 
 		 580 aa  233  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  31.52 
 
 		 682 aa  233  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  29.77 
 
 		 582 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  31.52 
 
 		 637 aa  231  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  32.07 
 
 		 676 aa  231  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  32.11 
 
 		 629 aa  231  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  29.11 
 
 		 553 aa  231  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4280  choline/carnitine/betaine transporter  29.2 
 
 		 720 aa  231  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.692689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  30.17 
 
 		 543 aa  231  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  28.69 
 
 		 581 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  30.5 
 
 		 555 aa  230  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  29.66 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  28.19 
 
 		 581 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  29.31 
 
 		 534 aa  229  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  32.54 
 
 		 694 aa  228  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  28.6 
 
 		 677 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 552 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  28.6 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  33.09 
 
 		 664 aa  227  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  32.08 
 
 		 642 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.22 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  30.78 
 
 		 505 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.51 
 
 		 550 aa  225  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2557  choline transport protein BetT  30.02 
 
 		 677 aa  225  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  31.14 
 
 		 503 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2828  choline transport protein BetT  30.17 
 
 		 682 aa  224  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  31.67 
 
 		 574 aa  224  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2914  choline transport protein BetT  30.17 
 
 		 682 aa  224  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  32.58 
 
 		 667 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  30.59 
 
 		 505 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  32.58 
 
 		 667 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>