260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12567 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  100 
 
 
250 aa  510  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  72.5 
 
 
287 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
236 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  45.21 
 
 
237 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  45.96 
 
 
223 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  45.15 
 
 
232 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  46.85 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.1 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  45.61 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  46.9 
 
 
230 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 
220 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  46.58 
 
 
228 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  43.53 
 
 
220 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  45.92 
 
 
234 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 
220 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 
220 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.49 
 
 
220 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 
220 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 
220 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  44.73 
 
 
232 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  48.66 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.93 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.88 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.15 
 
 
230 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  42.44 
 
 
227 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  45.07 
 
 
237 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  43.7 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  42.74 
 
 
236 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  44.68 
 
 
226 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  42.24 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  45.53 
 
 
230 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 
236 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 
233 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 
224 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  45.05 
 
 
232 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.18 
 
 
231 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 
236 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  41.56 
 
 
239 aa  165  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  41.41 
 
 
241 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  40.57 
 
 
239 aa  164  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.88 
 
 
232 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  43.22 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  45 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  41.33 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  45.25 
 
 
232 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  41 
 
 
239 aa  161  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.38 
 
 
224 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.33 
 
 
236 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 
232 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 
232 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  43.32 
 
 
224 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  42.37 
 
 
231 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  40.85 
 
 
237 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  40.85 
 
 
237 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.49 
 
 
231 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  43.28 
 
 
232 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 
225 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
234 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 
235 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 
232 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  40.44 
 
 
237 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  41.53 
 
 
232 aa  156  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  44.21 
 
 
250 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  47.32 
 
 
237 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  43.57 
 
 
232 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 
227 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  39.82 
 
 
222 aa  151  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  39.75 
 
 
237 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 
220 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  39 
 
 
220 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  39.58 
 
 
220 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 
226 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.48 
 
 
233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  37.78 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  45.12 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  36.24 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  41.42 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  40.35 
 
 
250 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  37.66 
 
 
228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  35.98 
 
 
236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  41.81 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  37.66 
 
 
228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  37.87 
 
 
238 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  35 
 
 
228 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  39.92 
 
 
220 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  37.92 
 
 
219 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  39.92 
 
 
237 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  41.77 
 
 
232 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3437  ribose-5-phosphate isomerase A  38.17 
 
 
225 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  42.67 
 
 
235 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  35.56 
 
 
236 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  36.6 
 
 
218 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 
232 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
262 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.55 
 
 
233 aa  141  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 
231 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  37.87 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  39.15 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>